TIM桶折叠类型的蛋白中,有三分之一都是糖苷水解酶。糖苷水解酶广泛存在于几乎所有生物体内,参与各种糖原的合成和降解。 一些特定糖苷水解酶的缺乏或变异会导致一系列的发育障碍乃至死亡。对糖苷水解酶催化机理的研究源远流长。从1953年Koshland提出基本的反应机理开始,随着后续蛋白质结构测定方法的成熟,越来越多的糖苷水解酶结构出现,大量点突变实验酶动力学实验及计算机模拟为大规模系统的研究糖苷水解酶机理提供了可能。 我们比对了130个亲源关系较远,
Tipifarnib,但是催化作用相似的TIM桶折叠类型糖苷水解酶的活性中心。这些糖苷水解酶主要采用了两种催化机理。一是经典的构象保持型反应机理,另一种是底物参与催化的构象保持型反应机理。